Voilà plus d’un millier d’années que les humains ont quitté la Terre dans un immense vaisseau appelé la Biosphère. À bord, quand les robots (zoïds) se révoltent contre les humains, York, 14 ans, est le seul qui parvienne à leur échapper. Il va vivre de multiples aventures, et découvrir un monde fait de violence et d’égoïsme, mais aussi de solidarité et d’amour.