Les Rebelles ont pris Coruscant, mais leurs problèmes sont loin d'être résolus. Un virus tueur, le Krytos, frappe la population non-humaine : le procès du capitaine Tycho Celchu, un héros de la Rébellion accusé de trahison, ajoute à la tension ; une contre-révolution semble inévitable. Alors que les agents provocateurs multiplient les actions terroristes, seul l'Escadron Rogue, par son courage et par son sang, peut sauver la cité-monde.

Pendant que ses camarades combattent et souffrent, Corran Horn, donné pour mort mais toujours prisonnier dans les geôles d'Ysanne Isard, découvre qu'il est seul à détenir la clé qui libérera Coruscant du joug de l'Empire.