Après avoir détruit les résultats d’années de recherche consacrées à l’ancien culte des Méne, le professeur-archéologue Frys est assassiné par un mystérieux meurtrier. Pour Lara Croft, les choses sont claires : son collègue a dû exhumer un dangereux secret, et on l’a assassiné pour s’assurer que ses révélations ne soient exposées au grand jour. Elle s’envole alors pour les mystérieuses forêts tropicales du Pérou qui abritent les ruines des Méne, et y fait une terrible découverte : une sorte de secte tente de ressusciter ce sinistre culte et ses méthodes pour contrôler les esprits. L’un des membres de ce groupe n’est autre que l’ancienne amie et protégée de Lara, la pilleuse de tombes Ajay – qui semble bien décidée à faire taire Lara... définitivement. Mais Lara, toujours prompte à relever un défi, en a décidé autrement.