Benjamin Parson s'est toujours senti différent des jeunes de son âge. Depuis sa plus tendre enfance il voit des choses et des créatures qui n'existent pas. Renfermé sur lui-même, il fait de son mieux pour mener une existence agréable malgré l'absence de son père, qui les a abandonnés, sa mère et lui. Jusqu'au jour où un cataclysme d'origine inconnue fait voler en éclats sa famille et sa maison.

Envoyé à l'orphelinat Lavoisier, il découvre par hasard une étonnante créature coincée dans un mur du sous-sol : un squelette, toujours vivant. Ce dernier lui révèle qu'il a été autrefois un alchimiste réputé... Et que Benjamin en est un lui aussi.

Très vite le jeune garçon va se retrouver plongé au cœur d'évènements dépassant de bien loin, les limites de sa compréhension...