L'Entreprise doit se rendre sur Akkalla, une planète essentiellement aquatique, pour effectuer une mission d'évaluation scientifique. Rien de bien inquiétant, même si Spock redoute beaucoup la susceptibilité de certains chercheurs !

Ce que le Vulcain ignore, c'est que les océans d'Akkalla dissimulent de très curieuses choses. De celles, par exemple, qui modifient toutes les idées qu'un peuple peut se faire de lui-même...

Evidemment, ce n'est pas du goût du pouvoir en place ! De là à se retrouver au centre d'un conflit écologique, politique et philosophique...